从芯片数据提取 lncRNA 探针

1 又是一篇放了好久好久,没有好好整理的东西。 1. 准备数据 需要数据有:芯片序列信息、基因组 lncRNA 参考基因组: 所用软件:SeqMap、R 芯片是 Affymetrix 的 Human Genome

RNA-Seq 数据处理记录

1 本来是 6 月份的东西,一直没有好好整理拖到年底了,唉 .... 毕业答辩过了,最大的坎儿迈过去了。准备开始处理手头拿到的 RNA-Seq 数据。当作是我的第一次实战。

回归分析中的共线性问题

主要参考博文 : Dealing with The Problem of Multicollinearity in R Multicollinearity in R 引子 如果现在我们预测一个国家,比如说中国,2018 年全年的旅游收入 (美元)。因变量是中国 2018 年度的旅游收入

Python 里 NumPy 的 axis 参数的理解

最近学学 Python 做数据分析,主要就是 Python 基本语法 + NumPy + pandas 咯。 发现很好的一些教程: python_for_data_analysis_2nd_chinese_version Numpy & Pandas (莫烦 Python 数据处理教程) Data analysis in Python with pandas 果然人生苦短,大家都在用 P

Tmux 入门和初步配置

今天决定学一下 Tmux 怎么用,因为经常发现要开几个 Terminal Tabs 处理不同的东西,然后要对照的时候来回切真的很累。手按快捷键累,眼睛盯着来回在跳动的文本也累。

SQLBolt 课程学习笔记五 (番外篇)

SQL Topic: Subqueries 子查询 You might have noticed that even with a complete query, there are many questions that we can’t answer about our data without additional post, or pre, processing. In these cases, you can either make multiple queries and process the data yourself, or you can build a more complex query using SQL subqueries. 一次查询经常回答不了很多

SQLBolt 课程学习笔记四 (13-18+X 课)

SQL Lesson 13: Inserting rows 第 13 课,添加行 We’ve spent quite a few lessons on how to query for data in a database, so it’s time to start learning a bit about SQL schemas and how to add new data. 前面都是在学怎么查询数据库,现在该了解一下数据库 Schema (

SQLBolt 课程学习笔记三 (9-12 课)

继续上课。 SQL Lesson 9: Queries with expressions 第 9 课,表达式查询。 In addition to querying and referencing raw column data with SQL, you can also use expressions to write more complex logic on column values in a query. These expressions can use mathematical and string functions along with basic arithmetic to transform values when the query is executed, as shown

SQLBolt 课程学习笔记二 (6-8 课)

昨天看了大火的《工作细胞》,挺有趣的。血小板太可爱了! 然后睡觉前看了一下 Todo list: 任重而道远啊,后面的课程还多着呢。继续继续—— SQL Lesson 6: Multi-table queries

SQLBolt 课程学习笔记一 (1-5 课)

终究还是要回来好好补课,看文档太无聊。看网上很多人都推荐 SQLBolt 这个在线网站学习课程,所以今天就打算来看这个了。 整个课程包括介绍 + 18 节课 + 结束课程