R 启动文件配置文件的加载

这个话题其实在之前两篇博文其实都有涉及到过,这次只是看到一些不错的资源和文档,所以干脆总结一下写得全面一点。 参考: R 文档: Initialization at Start of an R Session startup: Friendly

Bioconductor 中的 ExpressionSet 数据类型

1. 介绍 2. 从头构建一个 ExpressionSet 数据 Assay data Phenotypic data Annotations and feature data Experiment description Assembling an ExpressionSet 3. ExpressionSet 的一些基本特性 查看 ExpressionSet 的各个元素 取子集 本文翻译自 An Introduction to Bioconductor’s ExpressionSet Class

R 里的随机数种子 set.seed()

这一篇只写一点很简单的小东西,R 里用 set.seed() 设置随机数种子。 以前呢,只知道 set.seed(1234) 是设置随机数种子保证数据分析再现性的,但是其实具体用法没有了解过。现在

R 中因子型变量的有序与无序

有序和无序因子变量 例子 解读 模型评价和比较 结语 今天涉及到的这个就很有意思了。很早开始我就对这个问题有点疑惑,但是一直没有抽出时间(好吧,其实主

科学上网笔记:Shadowsocks 和 v2ray

搭梯简单记录,我知道网上教程一 Google 一大把。我写下来主要是这是我一直在用的流程,以免都要一边操作一边到处查,所以干脆就写下来算了。以后就可以咔咔

ggplot2 学习 第三部分:The Master List (上)

翻译整理自:Top 50 ggplot2 Visualizations - The Master List,有删改。 这是整个 ggplot2 系列的第三部分也是最后一部分。当然从标题知道这是上部,当然不是因为是最后一部分估计

ggplot2 学习 第二部分:外观自定义

ggplot2 学习 第二部分:外观自定义 翻译整理自:The Complete ggplot2 Tutorial - Part 2 | How To Customize ggplot2 (Full R code) 。 这一篇将会介绍如何自定义一个 ggplot 图的 6 个主要部分,是一份涵盖了大部分

ggplot2 学习 第一部分:介绍

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Logistic 回归中 AIC 和 BIC 用于变量筛选

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记一次 Debian sid 爆炸后的修复

前几天有点东西要写,Debian-cn 群里有人说 sid 更新 systemd-240-2 后炸了,我当时看到了以为个例没有特别去关注。然后过了一天看到置顶消息说 sid 和 Testing 用户不要

Netlify 的第一篇博客

这虽然可能显示出来并非是第一篇博文,但是确实是 Netlify 上的第一篇。没有显示为第一篇是因为我把其他平台的博文迁移到这里之后保留原始的发文日期。 Blogdown + Hugo

R 中缺失值的简单处理—— MICE 和 Amelia 篇

参考资料: Tutorial on 5 Powerful R Packages used for imputing missing values Amelia 包文档说明 Amelia II: A Package for Missing Data Imputing Missing Data with R; MICE package Handling missing data with MICE package; a simple approach 因为最近一直在学数据库和处理病例数据的相关的东西,

从芯片数据提取 lncRNA 探针

1 又是一篇放了好久好久,没有好好整理的东西。 1. 准备数据 需要数据有:芯片序列信息、基因组 lncRNA 参考基因组: 所用软件:SeqMap、R 芯片是 Affymetrix 的 Human Genome